В канализации Нью-Йорка нашли новые мутации SARS-CoV-2

Исследователи обнаружили по крайней мере четыре «загадочных» варианта SARS-CoV-2 в образцах сточных вод из канализационной системы Нью-Йорка, сообщает Science Daily.

Сначала «Дельта», потом «Омикрон» – эти варианты COVID-19 последние полгода распространяются по миру со скоростью лесного пожара. Это заставило многих ученых задаться вопросом, когда появится следующий штамм. 

Многопрофильная группа исследователей обнаружила как минимум четыре ранее неизвестных варианта SARS-CoV-2 в пробах сточных вод из канализационной системы Нью-Йорка. Их выводы были недавно опубликованы в журнале Nature Communications.

По данным Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC), такие вирусы, как SARS-CoV-2, могут постоянно развиваться. «Дельта» и «Омикрон» содержат одну или несколько мутаций в своей вирусной последовательности, которые помогают отличить их от других вариантов SARS-CoV-2.

Ученые предполагают, что «загадочные» мутации из нью-йоркской канализации могли появиться в результате заражения коронавирусом животных. Хотя их зоонозное происхождение еще не подтверждено, одним из возможных источников могут быть обитающие в канализационной системе крысы.

Идея этого проекта возникла в марте 2020 года, когда американские ученые вплотную занялись изучением возможного происхождения и дальнейшего развития COVID-19. Похожие исследования стартовали во многих странах мира. Первую попытку анализа сточных вод предприняли в Австралии – это вдохновило представителей ведущих университетов Америки обратиться к чиновникам из Департамента здравоохранения Нью-Йорка и Департамента охраны окружающей среды, чтобы те направили образцы сточных вод для проведения аналогичных работ. Параллельный анализ провели ученые из Сент-Луиса, где были обнаружены первые подозрительные вариации COVID-19.

Они были разными, но имели схожие мутации в конкретном месте вируса – Q498. В большинстве образцов из Нью-Йорка буква Q в Q498 превратилась в Y – глютамин трансформировался в тирозин. При этом в больницах города не диагностировали ни одного пациента-человека, у которого была подобная мутация, пишет Science Daily.

Возможным объяснением может быть биологический процесс, называемый конвергентной эволюцией. Инфицированное животное из Сент-Луиса не могло контактировать с животными того же вида в Нью-Йорке. Эволюция вируса в каждой географической области не зависит друг от друга, но поскольку это одно и то же животное, вирус выглядит одинаково в обоих местах. 

Отслеживание загадочных линий SARS-CoV-2, обнаруженных в канализации Нью-Йорка, все еще продолжается. Наблюдение за сточными водами действительно важно в контексте мер общественного здравоохранения. Оно является быстрым, недорогим и объективным, по этой причине его можно реализовать в регионах с низким уровнем тестирования и доступности вакцин.