У летучих мышей из США выявлены α-коронавирусы

Ученые выяснили, что альфакоронавирусы – распространенная инфекция у летучих мышей в верхней части Среднего Запада США, передает News Medical.

Коронавирусы (CoV) – обширное семейство РНК-вирусов семейства Coronaviridae отряда Nidovirales. По состоянию на 2020 год учеными обнаружено 43 вирусных представителя этой группы, которые подразделяют на четыре подгруппы. Альфакоронавирусы (alfaCoV) и бетакоронавирусы (betaCoV) заражают людей, коров, свиней, крыс, кошек, собак и летучих мышей, тогда как дельтакоронавирусы и гаммакоронавирусы в основном заражают птиц. Самым известным представителем семейства коронавирусов является SARS-CoV-2 – которому человечество обязано длительной пандемией.

Предполагается, что источником заражения COVID-19 стала летучая мышь из китайского города Ухань. Отсюда неподдельный интерес ученых к инфицированию рукокрылых в других регионах планеты.

Исследователи из Университета Южной Дакоты использовали ПЦР-тест для скрининга образцов 174 летучих мышей из Скалистых гор округа Миннехаха, самого густонаселенного региона штата. Целью ученых было найти новые CoV-вирусы рукокрылых, которые потенциально могут представлять опасность для человека.

12 гомогенатов из 174 образцов подтвердили наличие коронавируса. Положительные образцы поступали как из городских, так и из сельских источников примерно в равном количестве. 

Для всех 12 положительных результатов CoV у летучих мышей было проведено секвенирование по Сэнгеру. Было обнаружено, что они на 96,0-98,2% сопоставимы с частичными последовательностями альфакоронавируса, обнаруженными у Eptesicus fuscus (большой бурый кожан). 

Все белки этого коронавируса были поразительно похожи на альфакоронавирус HCQD-2020, недавно обнаруженный в Южной Корее.

Тем не менее белковый и генетический анализы показали, что все 12 CoV-положительных штаммов являются конспецифичными – распространяющимися в пределах одного вида.

По сравнению с другими частями мира, в США наблюдался относительно минимальный уровень эпиднадзора за CoV летучих мышей. Поскольку в этом исследовании использовались образцы из небольшого географического района, необходимо дополнительное наблюдение, чтобы установить широту разнообразия CoV у американских летучих мышей.